Transformasi tokong yang paling ketara berlaku semasa pemerintahan Raja Rama III. Mengiktiraf kepentingan perdagangan maritim, raja memerintahkan pengubahsuaian besar-besaran tokong dan menugaskan pembinaan struktur junk Cina (sampan) berskala penuh untuk menggantikan stupa tradisional. Keputusan seni bina yang inovatif ini mencerminkan kesedaran sejarah dan wawasan yang berpandangan jauh.

Struktur berbentuk junk itu berukuran kira-kira 44 meter panjang dan dibina daripada batu bata dan plaster. Direka bentuk menyerupai kapal dagang Cina yang pernah menguasai perdagangan serantau, ia menempatkan dua chedi (stupa) di dalam kawasan deknya. Chedi yang lebih besar menampilkan dasar berlekuk dua belas penjuru, manakala yang lebih kecil mengikut bentuk bulat yang lebih konvensional.

Secara simbolik, junk berfungsi sebagai monumen kepada era apabila Siam makmur melalui perdagangan maritim, terutamanya dengan China. Raja Rama III juga meramalkan bahawa junk tradisional Cina akhirnya akan digantikan oleh kapal wap gaya Barat—ramalan yang kemudiannya menjadi kenyataan apabila perdagangan global dimodenkan.

Selain daripada chedi junk, kawasan tokong termasuk dewan pentahbisan yang direka indah yang mengabadikan imej Buddha utama dalam postur Mara-Vijaya (menundukkan Mara). Tokong ini juga menampilkan Bangunan Maha Chedsadabodin, dewan pelbagai guna gaya Thai yang digunakan untuk retret meditasi, upacara keagamaan dan aktiviti kemasyarakatan.

Terletak di sepanjang sungai dan berhampiran daerah perniagaan moden Bangkok, Tokong Yannawa berfungsi sebagai tempat perlindungan rohani dan mercu tanda sejarah. Ia menawarkan pengunjung wawasan tentang warisan maritim Thailand dan hubungan budaya Thai–Cina yang mendalam yang membentuk pembangunan negara.